Il Cenacolo di Sant’Apollonia, fondato nel 1339 e ampliato a partire dal Quattrocento, era il refettorio del monastero delle benedettine osservanti dedicato alla santa omonima; le ampie dimensioni dell’ambiente riflettono la presenza di una comunità numerosa. Sulla parete di fondo è possibile ammirare l’Ultima Cena affrescata da Andrea del Castagno nel 1447.